Das WZHS wurde während des 1. Weltweiten Humanistischen Forums, das Ende Oktober 1993 in Moskau stattfand, auf Initiative von Silo gegründet. Es begann seine Aktivitäten im Rahmen der Orientierung des Universalistischen Humanismus. Diese erste Etappe dauerte bis Anfang 1998.

Während der ersten Etappe veranstaltete das WZHS Seminare und führte Studien durch, die sich der Forschung von humanistischen Traditionen und Erneuerungen in den verschiedenen Kulturen sowie der Ökonomie und den Sozialwissenschaften im Allgemeinen widmeten. Diese Seminare wurden gemeinsam mit Instituten der Russischen Akademie der Wissenschaft, Kultur- und Bildungszentren in Buenos Aires, Santiago de Chile, Mexiko, Madrid sowie mit anderen Universitäten und wissenschaftlichen Institutionen durchgeführt. 1994 nahm es am 2. Humanistischen Forum in Mexiko teil und im darauf folgenden Jahr am „Offenen Treffen des Humanismus“ in Santiago de Chile.

Das Ergebnis dieser Forschungen wurde in Form des „Jahresbuch des Weltzentrum für Humanistische Studien“ in den Jahren 1994, 1995, 1996 und 1997 veröffentlicht. Des weiteren wurde das „Wörterbuch des Neuen Humanismus” von Silo veröffentlicht, das heute Bestandteil des II. Bandes seiner Gesammelten Werke bildet.

Ab April 2006 begann das Zentrum für Humanistische Studien in Buenos Aires, der Kontinuität des WZHS Antrieb zu verleihen. Im gleichen Jahr kamen die Zentren für Humanistische Studien (ZHS) in Barcelona, Santiago de Chile, Madrid, Moskau, París und Rom hinzu.

Eine fortlaufende Tätigkeit begann, die sich durch die autonomen und gleichzeitigen Aktivitäten der ZHS in den verschiedenen Städten und Ländern auszeichnete, ebenso wie durch die Weiterentwicklung der dem WZHS eigenen Methodologie des Studiums und der Forschung, die anhand von Seminaren bearbeitet wurde, die in verschiedenen amerikanischen und europäischen Städten stattfanden. 

Im November 2008 fand im Park zum Studium und zur Reflektion in Punta de Vacas – mit unmittelbar vorhergehenden Präsentationen in der argentinischen „Universidad de Cuyo” und der chilenischen „Universidad de Santiago de Chile” – das 1. Internationale Symposium des WZHS statt: „Die Ethik im Wissen”. Im Rahmen dieser Veranstaltung wurde die Weltföderation der Zentren für Humanistische Studien gegründet, die sich aus den oben erwähnten ZHS und anderen in Entstehung begriffenen Zentren zusammensetzt, wobei die Anwesenden die „Ethische Verpflichtung“ eingingen.

Im April 2009 veranstalteten die europäischen ZHS ein „Internationales Symposium über Gewaltfreiheit”, das im italienischen Park zum Studium und zur Reflektion in Attigliano stattfand.